傳說在地球被一顆隕石撞擊之後,另一半的星球上的生靈在日益毀壞的生態環境下,麵臨越來越痛苦的境遇。斯凱普林管道公司在挖掘地下時,將兩個世界打通。馬裏奧和魯基兄弟本來是管道工,因為戴西被抓,他們一同進入岩層,來到由庫帕控製的另一個世界。庫帕運用他的機器,可以將生物隨意進化或退化,而可以統一兩個世界的正是戴西,她手中的隕石碎片成了大家爭搶的目標。兄弟二人發揮了他們的所長,幫助戴西使父親複原,並穩定了混亂的局勢。
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